Die Klinik und Institutsambulanz für Kinder- und Jugendpsychiatrie und Psychotherapie arbeitet sehr eng mit umliegenden Kooperationspartnern zusammen. So werden im Einverständnis der Eltern Informationen von den Vorbehandlern, wie z.B. Berichte der niedergelassenen Ärzte oder der Nachbarkliniken eingeholt. Auch während eines Aufenthaltes in der Klinik ist der Austausch zwischen den verschiedenen Behandlern wichtig. Außerhalb der klinischen Versorgung gilt es in vielen Fällen Kontakt zu anderen Einrichtungen, wie den Jugendämtern, Einrichtungen der Jugendhilfe, Schulen oder Selbsthilfeorganisationen aufzunehmen, um die medizinische Behandlung in ein funktionierendes Netzwerk mit allen Helfersystemen einzubinden. In Kooperation mit den entsprechenden Einrichtungen werden die Behandlungs- und Unterstützungsmaßnahmen z.B. in Runden Tischen abgestimmt, geplant und umgesetzt.
Mit der Wohngruppe für seelisch kranke Jugendliche des Dinglinger Hauses in Lahr besteht eine Kooperationsvereinbarung. Der Chefarzt der Kinder- und Jugendpsychiatrie Herr Prof. Strehlow übernimmt dabei einmal im Monat die medizinische Betreuung der psychisch erkrankten Jugendlichen vor Ort.
Auch mit der Reha-Werkstatt der Gesellschaft zur Förderung psychisch Kranker in Offenburg besteht eine enge, regelmäßige Zusammenarbeit. Für unsere jugendlichen Patienten gibt es dabei die Möglichkeit, eine Belastungserprobung in der Werkstatt durchzuführen.